首先fine_circ是在py27运行，需要numpy和pysam这两个库，pysam不支持windows系统，所以建议在linux下运行。使用到软件VMWare,pycharm。
首先先尝试pip install pysam或者conda 指令，如果失败，在加上镜像文件试一次，如果还失败，请使用wheel文件安装。
参考以下链接：
科学网—Bowtie2和Samtools软件更新 - 卢锐的博文
（1）bowtie2生成基因组索引
首先使用bowtie2生成.bam排序文件，其他的比对程序也可以，能产生bam文件的都可以
（2）
本文发布于:2024-01-29 06:58:55，感谢您对本站的认可！
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