使用R包genomation中的readTranscriptFeatures工具对我的.ded12文件进行处理时，出现错误‘times‘参数不对

使用R包genomation中的readTranscriptFeatures工具对我的.ded12文件进行处理时，出现错误‘times‘参数不对

问题描述

我查询了很多地方，发现我研究的物种没有组装完整的染色体，因此它的染色体名称不是standard/typical，以下是我的.ded12文件。解决方法，忽略染色体名称

gene_anno =readTranscriptFeatures("genes.bed12",remove.unusual=FALSE, up.flank = 2000, down.flank = 200)

加上remove.unusual=FALSE即可。