trimmomatic竟然“无法解析”出gz压缩文本了，你遇到这个问题了吗？老老实实换回fastq

trimmomatic竟然“无法解析”出gz压缩文本了，你遇到这个问题了吗？老老实实换回fastq

下载了一个TCR beta的序列，用fasterq-dump转换序列，这个比fastq-dump 稍微快一些，不过没有了压缩功能，所以为了占用少的硬盘空间，在解析后需要自己压缩成gz或bz2。但是神奇一幕发生了，我手动压缩成.gz格式后，用trimmomatic进行去接头，但是死活就是运行不下去，并出现如下报错：

trimmomatic PE -threads 2 -phred33 SRR4449813.sra_ SRR4449813.sra_ paired_1_R1_ unpaired_1_R1_ paired_1_R2_ unpaired_1_R2_ ILLUMINACLIP:/home/decen/miniconda3/pkgs/trimmomatic-0.38-1/share/trimmomatic-0.38-1/adapters/TruSeq3-PE.fa:2:30:10 LEADING:3 TRAILING:3 SLIDINGWINDOW:4:15 MINLEN:36
TrimmomaticPE: Started with arguments:-threads 2 -phred33 SRR4449813.sra_ SRR4449813.sra_ paired_1_R1_ unpaired_1_R1_ paired_1_R2_ unpaired_1_R2_ ILLUMINACLIP:/home/decen/miniconda3/pkgs/trimmomatic-0.38-1/share/trimmomatic-0.38-1/adapters/TruSeq3-PE.fa:2:30:10 LEADING:3 TRAILING:3 SLIDINGWINDOW:4:15 MINLEN:36
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