中国撒拉族常染色体STR基因座遗传多态性研究

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2024年2月8日发(作者:)

中国撒拉族常染色体STR基因座遗传多态性研究

中国撒拉族常染色体STR基因座遗传多态性研究

本文利用常染色体的15个STR基因座,对西北特有少数民族撒拉族进行基因扫描,获得15个STR位点的A基因频率、杂合度、个体识别能力、非父排除率、累计非父排除率、耦合率和多态信息含量等遗传信息,显示15个STR位点具有中度或高度多态性,结论:所选择的15个STR位点具有中等或较高的个体识别力和多态性信息量,可用于群体遗传学和法医学研究。

标签:西北特有少数民族;STR基因座;遗传多态性

撒拉族是三个位于中国西北部的特有少数民族,其语言属阿尔泰语系突厥语族西匈奴语支的乌古斯语组,主要聚居在今天甘青结合部的青海循化、化隆二县以及甘肃省积石山县大河家一带。据2000年第五次全国人口普查资料,全国的撒拉族人口为104503人。

短串联重复序列(short tandem repeat,STR)属微卫星DNA序列,重复单位为2~7 bp。STR基因座在人类基因组中含量丰富,分布广泛,据估计三核苷酸和四核苷酸重复序列的STR基因座约有20万个,平均每隔15~20 kb就有一个。它不仅是绘制基因组物理图谱和遗传连锁分析的理想标记,也是群体遗传学和法医遗传学高信息基因座的丰富来源。在法医同一认定、亲缘关系鉴定、人口遗传结构和疾病相关性研究等方面发挥重要作用[1]。

1资料与方法

1.1一般资料 撒拉族多名无关个体FTA血卡样本全部来自日常案检积累。

1.2方法 采用美国AB公司AmpFSTR○R华夏TMPCR直接扩增试剂盒,在AB 9700型扩增仪上对15个STR基因座进行复合扩增。PCR扩增体系为10?滋l,PCR产物经AB 3500XL毛细管电泳,用GeneMapper○RID-X 1.0.1版进行电泳数据分析。应用PowerStats软件计算,得到15个STR基因座的基因频率、观察杂合度(Ho)、个体识别能力(DP)、非父排除率(PE)、耦合率(Pm)和多态信息含量(PIC)[2]。

2结果与讨论

西北特有撒拉族人群无关个体15个STR基因座等位基因及其频率分布见表1。各基因座的群体遗传学参数见表2。撒拉族人群中,个体识别力0.50~0.84,D8S1179最低,多态性信息含量0.50~0.80,非父排除率0.08~1.00。说明这15个STR在撒拉族群体中具有较高多态性,可以用于该地区法医学亲子鉴定和个体识别。

参考文献:

中国撒拉族常染色体STR基因座遗传多态性研究

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标签:基因座   遗传   多态性   个体   扩增   研究
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