试剂盒提DNA步骤

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2024年10月2日发(作者:)

试剂盒提DNA步骤

OMEGA--D5525-01型水样中DNA提取试剂盒

E.Z.N.AWaterDNA Kit

TM

D5525-01试剂盒内含:

Hinbind DNA结合柱50个,2mL收集管100个,玻璃珠27g,HTR试剂10mL,BufferSLX

180mL,SP2 Buffer 60mL,XP1 Buffer40mL,Elution Buffer 30mL,DNA Wash Buffer 20mL。

有关Buffer GPS

硅胶柱(即Hinbind DNA结合柱)经Buffer GPS预处理后可大大减少柱子中硅胶膜的憎

水基团,提高核酸的结合能力。柱子在长期放置过程中会同空气中的电荷/尘埃发生反应而

影响其核酸的结合能力。Buffer GPS是强碱性溶液,若不小心碰到,请用大量自来水清洗。

用完后需盖紧瓶盖,以免接触空气。室温保存Buffer GPS。在保存过程中可能会有沉淀生成,

请加热至37℃使沉淀完全消失。

需要准备的:

预定工作台(9:00—16:00)超净台在开紫外前先用75%的酒精棉擦拭以使台面尽量无菌,

预定4℃离心机(10:00-(至少定3h),采水样,清洗抽滤装置(擦洗灭菌),(95%乙醇泡烧)

无菌镊子、剪刀,水浴锅(先设定为70℃,冰盒(70℃水浴时制即可)、试剂盒,异丙醇,

无菌锡箔纸、吸水纸、1000μL移液器及枪头,黄枪头,计时器,灭菌勺,离心管架,转速

约14000g的离心机,灭菌50mL离心管,灭菌1.5mL离心管, ddH2O,0.22μm微孔滤膜,

75%酒精及灭菌脱脂棉(用来擦洗已提过水样的漏斗),放镊子剪刀大离心管等的试剂架。

Buffer GPS对硅胶柱的前处理:(在超净台中操作,可以在第10步时处理柱子)

1. 取一个新的Hinbind DNA结合柱装在收集管中,吸取合适体积的Buffer GPS平衡缓冲液

(小柱提取用200μL,中柱提取用1mL,大量提取用3mL)至柱子中。室温放置3~5min。

2. 室温下,12000g,离心2min。

3. 倒弃收集管中的滤液,把Hinbind DNA柱子重新装在收集管中;加入700μLddH2O至柱

子中。

4. 室温下,12000g,离心2min。

5. 倒弃收集管中的滤液,把Hinbind DNA柱子重新装在收集管中。这就是平衡好的柱子。

注意:该流程处理好的柱子可室温放置1~2周。

DNA提取:(试剂盒内试剂的打开需要在超净台上)

1. 事先用80mL无水乙醇将DNA Wash Buffer稀释后室温保存。

2. 在超净工作台中,将无菌滤膜打开,一手用灭菌的镊子夹住另一只手用剪刀沿滤膜滤膜

外缘约减去1cm的圆环(以能盖住漏斗的孔径为宜),放入抽滤装置的无菌漏斗中。用

0.22μm微孔滤膜过滤水样。(所用水样体积取决于所采集水样的浑浊度,对于浑浊度高

的水样建议先用较大孔径的滤膜过滤以防阻塞微孔。)海水样提取时,需要保存的样品,

有菌面对折后用无菌锡箔纸包住,装于一灭菌袋中,标记好后放于-60℃保存。

3. 用镊子将滤膜从漏斗中取出、折叠,用剪刀将其剪碎入一个50mL的无菌离心管中。

4. 向离心管中加3mLSLX Buffer和500mg玻璃珠(约3小勺)。

5. 最大转速涡旋震荡3min左右,使样品与溶液彻底混匀,使膜上菌体进入溶液。

6. 70℃或90℃水浴10min使菌体裂解涡旋震荡2~3次。(制冰盒)

7. 向管中加1mLSP2 Buffer涡旋震荡30s。冰浴5min。

8. 4℃,4000g离心10min。(配平)

9. 在超净台中将上清转移至一新的15mL或50mL管中,加0.7倍体积的异丙醇。翻转混匀

30~50次,在-20℃下至少放置30min。期间翻转几次。(将水浴锅调至65℃)

10. 4℃,10000g离心20min使DNA沉降。

11. 将离心管平放,使以沉降的DNA贴于壁上在室外将液相倒掉后将管倒扣在吸水纸上沥

干,若还有残留,则在超净台中用移液器吸去。

12. 向管中有DNA沉降处加400μL Elution Buffer,吸打混匀,是DNA溶解后将其转入1.5mL

无菌离心管中,涡旋震荡彻底混匀20s。在65℃水浴10~30min以溶解DNA。(如果想得

到不含RNA的DNA,在这一步向样品中加10μLRNA酶A(25mg/mL)。

13. 向1.5mL离心管中,加100μL HTR Reagent(试剂)。旋转震荡混合10s后室温放置2min。

(注意:用HTR Reagent(试剂)前要用涡旋仪将其彻底震荡混匀。)

14. 12000rpmin高速离心3min使HTR Reagent沉降。(若转速达不到可以降低转速增加离

心时间。注意:若经HTR Reagent提取后样品仍然显棕色或深色,则用HTR Reagent重

复13~14步提取。)

15. 将上清(通常约400μL)转移至一新的1.5mL离心管中,加入等体积的XP1 Buffer。通

过旋转震荡充分混匀。

16. 将处理的DNA吸附柱放入一个2mL的收集管中(试剂盒中提供,该步已作)。

17. 将样品全部转入该DNA吸附柱中,室温下,10000rpmin离心1min。将离下的液相倒掉,

重新将吸附柱放回收集管中。(该步重复)。

18. 向吸附柱中加300μL XP1 Buffer,室温下,10000rpmin离心1min。弃去收集管和其中的

液相。

19. 将吸附柱放入一个新的2mL收集管中,加750μL DNA Wash Buffer(用无水乙醇稀释),

10000rpmin离心30s 。弃去液相,将吸附柱重新放回收集管中。

20. 最大转速空离2~3min,使吸附柱干燥。(空离完后在超净台中开盖晾干2min。该步对

去除乙醇残余至关重要,乙醇残留可能会影响下游酶的使用。)

21. 将吸附柱放入一个新的1.5mL离心管中,将50~100μL DNA Elution Buffer垂直悬空加至

吸附柱中央,65℃水浴3min。最大转速离心1min洗提回收DNA。(枪头不要碰触吸附

柱,先加50μL Elution Buffer水浴离心完后换个1.5mL离心管,再加30μL Elution Buffer,

水浴离心,将两次得到的DNA溶液合并后再分装,一个30μL、一个50μL,前者放4℃

常用,后者-20℃低温储存)。

22. 得到的DNA洗提样品-20℃保存。

注意事项:

1. 剪刀、镊子提前烧好冷却灭菌。

2. 抽滤时,将滤膜放于漏斗中后先加入少许水样将滤膜润湿,打开抽滤泵使滤膜紧紧吸附

于漏斗底部,然后再将水样缓缓倒入。这样可以避免滤膜漂浮起来。

3. 水浴锅先开70℃

试剂盒提DNA步骤

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标签:水样   灭菌   无菌   离心管
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